Desinfecção descreve o método capaz de eliminar muitos ou todos os microrganismos patogênicos, com exceção dos esporos. Os hipocloritos e outros compostos clorados geram a Desinfecção de médio nível, onde, além dos microrganismos destruídos na desinfecção de baixo nível, são atingidos o Mycobacterium tuberculosis, a maioria dos vírus e a maioria dos fungos. Ainda sobrevivem os Mycobacterium intracelulares, os esporos bacterianos e os vírus lentos. Duas das reações químicas que geram tais compostos desinfetantes são:
zCl₂ + NaOH → NaCl + NaClO +H₂O
KClO₃ + H₂SO₄ → xHClO₄ + yClO₂ + K₂SO₄ + H₂O
A soma z, x e y, após o balanceamento das equações com os menores coeficientes inteiros, será de