O tubo neural é originado das invaginações do mesoderma e dará origem aos elementos do sistema nervoso. 

O notocorda surge da propagação de células do endoderma, localizadas no teto do intestino primitivo no embrião da maioria dos animais, tendo a função de sustentação para o corpo e, nos vertebrados, é a base para a formação da coluna vertebral. 

O celoma é originado a partir do ectoderma e, nos animais ditos celomados, servirá como cavidade que alojará diversos órgãos. 

O arquêntero surge ainda na fase de blástula e, nos animais, formará a cavidade digestiva.