São considerados hotspots todas as áreas que apresentam uma grande biodiversidade, mas que se encontram em alto risco de degradação ambiental (já devastada e tendendo a se agravar). Em outras palavras, são áreas críticas para a conservação, pois a sua biodiversidade se encontra ameaçada de extinção. Os critérios para a classificação das áreas em um hotspots, é que ela possua – no mínimo – 1 500 espécies endêmicas de flora e que tenha perdido mais de 75% de sua vegetação natural. No Brasil, dois biomas são considerados hotspots. Como se tratam de áreas com grande biodiversidade, além da riqueza em termos de flora (vegetação), inclui-se as espécies da fauna (animais).