Eucariontes atuais possuem traços de genes dos cloroplastos e das mitocôndrias incorporados ao RNA-m, indicando que houve manutenção dos genes endossimbióticos primitivos.

Os organismos clorofilados que surgiram exclusivamente por endossimbiose terciária estão representados pelas algas glaucófitas, algas vermelhas e algas verdes.

Somente representantes do grupo Arqueplastida apresentam cloroplastos derivados de uma endossimbiose primária.

No evento da endossimbiose, uma célula eucariótica teria englobado bactérias anaeróbias, as quais deram origem aos cloroplastos.

Os processos que deram origem às mitocôndrias são classificados como eventos endossimbióticos secundários.