O berquélio apresenta 97 prótons e 19 radioisótopos identificados, sendo os mais estáveis: Bk-247 com uma meia-vida de 1380 anos, Bk-248 com uma meia-vida superior a 9 anos, e Bk-249 com meia-vida de 320 dias. Os demais isótopos radioativos possuem meias-vidas inferiores a 5 dias, e a maioria deles com meias-vidas abaixo de 5 horas.
No processo de decaimento do isótopo de berquélio com maior duração, pela emissão sucessiva de partículas alfa e beta, forma-se o isótopo estável ₈₂Pb²⁰⁷. Os números de partículas alfa e beta emitidas nesse processo são, respectivamente: