As células eucarióticas podem apresentar diferentes vacúolos que são denominados conforme a sua função no citoplasma. Os vacúolos, em geral, são compostos por membranas fosfolipídicas originárias da membrana plasmática, do retículo endoplasmático agranular ou ainda da combinação dessas membranas com as de outras organelas, como o lisossomo. No quadro, foram assinaladas as origens das membranas de três vacúolos com diferentes funções.