Este fenômeno é causado pela explosão populacional de protoctistas (Dinoflagellata).

A eutrofização (excesso de matéria orgânica e nutrientes em águas litorâneas) impulsiona a reprodução de protoctitas.

Lançamento de esgotos na água são uma das principais causas da eutrofização, e consequentemente da marévermelha.

Uma das principais consequências da maré-vermelha na biodiversidade, no curto prazo, é a super reprodução dos peixes.

As espécies causadoras da maré-vermelha produzem toxinas.