A maioria dos rios e dos lagos possuem um pH entre 6 e 8. O pH dos lagos, no entanto, pode atingir valores aproximados a 5. Quando os solos e a água não têm a capacidade de neutralizar a chuva ácida, todos os organismos que vivem em meios aquáticos poderão morrer por consequência desse fenômeno. Os sapos suportam as variações de pH maiores e poderiam resistir, mas, se o seu alimento também desaparecer, acabarão morrendo. À medida que a acidez dos lagos aumenta, os peixes vão desaparecendo. Mesmo que alguns mais resistentes consigam sobreviver, é muito difícil que a sua continuidade esteja assegurada uma vez que os seus ovos serão incapazes de eclodir.