Nos peixes cartilaginosos, a boca é ventral e o intestino curto termina diretamente no ânus.

A bexiga natatória, presente nos peixes ósseos, é um órgão sensorial envolvido na percepção de vibrações e de pressões do meio externo.

A cloaca, presente nos peixes cartilaginosos, é importante no processo de trocas gasosas, uma vez que as brânquias desses animais não possuem opérculos.

Os peixes ósseos, diferentemente dos cartilaginosos, são considerados amoniotélicos.