As proteínas são polímeros cujas unidades constituintes fundamentais são os aminoácidos. Os aminoácidos, por sua vez, são moléculas orgânicas que possuem um átomo de carbono, denominado α ao qual estão ligados a um átomo de hidrogênio, um grupo amina, um grupo carboxílico e uma cadeia lateral “R” característica para cada aminoácido. Essa cadeia lateral é o que difere os aminoácidos em sua estrutura, tamanho, cargas elétricas e solubilidade em água. A seguir são apresentados aminoácidos com suas respectivas fórmulas estruturais.
1. Cisteína: SH-CH₂-CH(NH₂)-COOH
2. Alanina: CH₃-CH(NH₂) –COOH
3. Fenilalanina: C₆H₅-CH₂-CH(NH₂)-COOH
4. Serina: OH-CH₂-CH(NH₂)-COOH
5. Asparagina: NH₂-CO-CH₂-CH(NH₂)-COOH
6. Ácido aspártico: HOOC-CH₂-CH(NH₂)-COOH
Quais dos aminoácidos são hidrófobos e quais tendem a formar ligações de hidrogênio.